はてなダイアリー検索 - 制限酵素とは
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オフィシャルの検索機能は先頭に広告やキーワードが配置され、
若干使いづらいので自分で作ってみました。
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「制限酵素」とは - Ligaseが「のり」に例えられるのに大して制限酵素は「はさみ」によく 例えられる。 DNA中の特定の配列を識別して、DNAを切断する酵素の総称をいう。 認識する配列によってさまざまな制限酵素が存...
http://d.hatena.ne.jp/keyword/%C0%A9%B8%C2%B9%DA%C1%C7
2009年11月12日 ... とはいえ制限酵素には、いくつかの制約もつきまといます。まず制限酵素によって切断 できる配列には限りがあることが挙げられます。今まで数百種類の制限酵素が知られ ていますが、それぞれ切断できる配列は決まっており、任意の配列を ...
http://d.hatena.ne.jp/TodaiGCOE/20091112/1258017630
2009年11月12日 ... とはいえ制限酵素には、いくつかの制約もつきまといます。まず制限酵素によって切断 できる配列には限りがあることが挙げられます。今まで数百種類の制限酵素が知られ ていますが、それぞれ切断できる配列は決まっており、任意の配列を ...
http://d.hatena.ne.jp/TodaiGCOE/20091112
2009年11月12日 ... セリウム(IV)によるリン酸エステル結合の切断. といっても、これだけでは1本鎖のDNAを 切れるというだけであり、二重らせんの狙ったところだけを切断するという目標には ほど遠いものです。「人工制限酵素」という夢のためには、さらなる工夫が ...
http://d.hatena.ne.jp/TodaiGCOE/20091112/1258017631
2011年7月21日 ... バクテリアゲノム上の制限酵素認識配列の分布を知りたい」と言われたので、作業して みた。 要件. ・これまでの制限酵素の認識配列として見つかってない配列でも検索 したい・認識配列がパリンドロームじゃないときはtop, bottomの両鎖での ...
http://d.hatena.ne.jp/hornistyf/20110721/1311257996
2011年9月15日 ... このとき、CDSは両方の鎖にそれぞれプロットされるので、CDSの代わりに制限酵素 認識配列の座標をプロットすれば今回の目的は達成出来る。 そのためには、CDSの 代わりに認識配列を書き込んだgenbank fileを作成する必要がある。
http://d.hatena.ne.jp/hornistyf/20110915/1316015130
2011年2月21日 ... 制限酵素は2本鎖DNAのある特定の塩基配列を認識し、その部分でのみDNAを切断 する働きを持つ酵素で、細菌から抽出され利用されている。制限酵素には多くの種類が あるが認識される塩基配列は制限酵素によって異なる。つまり、 ...
http://d.hatena.ne.jp/pilot_doctor2/20110221/1298296877
2011年2月18日 ... 細菌の持つ制限酵素は特定の塩基配列を認識してDNAを切断する酵素である。制限 酵素は細菌固有の細菌防御機構であると考えられるが、分子生物学研究に欠かせない 道具として使用されている。制限酵素について以下の問に答えよ。
http://d.hatena.ne.jp/pilot_doctor2/20110218
2011年3月7日 ... 制限酵素は2本鎖DNAのある特定の塩基配列を認識し、その部分でのみDNAを切断 する働きを持つ酵素で、細菌から ... つまり、それぞれの制限酵素の基質は2本鎖DNA 上の特定の塩基配列であり酵素によって基質(((特異性)))が異なる。
http://d.hatena.ne.jp/pilot_doctor2/?of=5
2006年8月7日 ... NEBが自社のサイトでオンラインで制限酵素切断サイト検索サービスをやってますが( NEBcutter)、それより使いやすいです。 このソフトの利点は、制限酵素の簡単な特徴を 日本語で表示してくれるとこです。 たとえばEcoRIだったら、. EcoRIは ...
http://d.hatena.ne.jp/mittyu/20060807/p1
2007年11月6日 ... 制限酵素の基礎知識 00:09 制限酵素の基礎知識を含むブックマーク 制限酵素の基礎 知識のブックマークコメント. 「制限酵素の基礎知識」は第一薬品だったかどこだっ たかの販促パンフレットで、キラーコンテンツであった。あれが、ワーク ...
http://d.hatena.ne.jp/extinx0109y/20071106/1194361781
2006年10月24日 ... このソフトは以前は制限酵素のデータベース的ソフトだったんだけど、バージョンが あがって塩基配列中の制限酵素サイトを調べたり、ORFを ... 左側にサイトのある制限 酵素が一覧され、項目をクリックすると位置や酵素の情報等が表示される。
http://d.hatena.ne.jp/k-kuro/20061024
2006年10月24日 ... このソフトは以前は制限酵素のデータベース的ソフトだったんだけど、バージョンが あがって塩基配列中の制限酵素サイトを調べたり、ORFを ... 左側にサイトのある制限 酵素が一覧され、項目をクリックすると位置や酵素の情報等が表示される。
http://d.hatena.ne.jp/k-kuro/20061024/1161615600
2010年6月5日 ... そこで，混入物を取り除くために，複数の方法で100 kbp中間体を精製*7したことが成功 の鍵となった． このようにして作製したMmゲノムの中には，間違って繋がったものも 含まれている．PCR法*8や制限酵素処理の切断パターン*9から，100 ...
http://d.hatena.ne.jp/popeetheclown/20100605/1275761595
2010年6月9日 ... 細菌にとっての外敵であるファージ*5が感染した際には，制限酵素がファージのDNAを 切断することで，感染を食い止める．しかし， ... 修飾酵素*6が自身のゲノムDNAの特定 の配列をメチル化することで，制限酵素はDNAを切断できなくなる．
http://d.hatena.ne.jp/popeetheclown/20100609/1276099678
2012年3月23日 ... ただし，検出できる多型は制限酵素認識部位＆プライマー部位（認識部位の隣接数 塩基）のそれを反映したもののみです． 幾種類かのプライマーペアを使うことで探索 空間を拡げます． （参照： Life Technologies > AFLP 法） 上の論文の概要 ...
http://d.hatena.ne.jp/molecojp/20120323/1332451134
2012年5月11日 ... ただし，検出できる多型は制限酵素認識部位＆プライマー部位（認識部位の隣接数 塩基）のそれを反映したもののみです． 幾種類かのプライマーペアを使うことで探索 空間を拡げます． （参照： Life Technologies > AFLP 法） 上の論文の概要 ...
http://d.hatena.ne.jp/molecojp/
2012年4月13日 ... 制限酵素系はまだ入ってないみたい ・preg 正規表現が難しいのでパス（ ・revseq 前 やった。配列の逆・相補変換。 ・backtranseq どのコドンを使って逆翻訳してんの ・ fuzznuc 特定の短い配列を打ち込んで検索 ・getorf. ORFが全部出てきた ...
http://d.hatena.ne.jp/tryalnigro/20120413/1334292546
Smith-Waterman local alignment 大域的アラインメント。merger、needleよりも ギャップが少ない。 スペースが読めない。 ・wordmatch 完全一致部分を見つけるもの スペースが読めない ・showalign emmaがないので読めない ・restrict ・remap 制限 酵素系は ...
http://d.hatena.ne.jp/tryalnigro/
2011年1月14日 ... 「PCRとか，制限酵素，大腸菌の扱い，必要なテクニックが山ほどある」. ほんとやめて ほしいですね． ... 一般化できないから，賢くないとわかっていてもTmをいたづらに変えて みたり，酵素を変えてみたりするんです． 「謎の経験則」がまかり通っ ...
http://d.hatena.ne.jp/koikoi2011/20110114/1295018480